نگاه ایران:محققان مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران موفق شدند تا برای نخستین بار ظرفیت میکروبیوم آبهای بخش جنوبی دریای کاسپین را با استفاده از روش «متاژنومیکس» مورد بررسی قرار دهند.
دکتر ابوالحسن شاهزاده فاضلی رئیس مرکز در این ارتباط اظهار داشت: در پژوهش انجام شده با استفاده از روشهای توالییابی پر بازده، ساختار جمعیت میکربی دریای کاسپین تعیین و ژنوم میکروبهای شاخص آن بازسازی شد.
در این پژوهش، نمونه های میکروبی از سه عمق 15، 50 و 150 متری ستون آبی منطقه جنوبی دریای کاسپین جمع آوری شدند و توالی ژن 16S rRNA در آنها مورد بررسی قرار گرفت.
وی افزود: نتایج حاصل، تشابه ساختار کلی جمعیت میکروبی در هر سه عمق را نشان داده است اگرچه تفاوتهایی با ساختار جامعه میکروبی در محیطهای آبی اقیانوسی و آب شیرین محیطهای معتدل به چشم می خورد.
وی افزود: ژنوم های مونتاژ شده بر حضور میکروارگانیسم هایی در گروههایActinobacteria، Alphaproteobacteria، Betaproteobacteria، Gammaproteobacteria، Bacteroidetes، Cyanobacteria، Euryarchaeota و Thaumarchaeota دلالت دارند.
فاضلی در ادامه خاطرنشان کرد: نتایج بررسی ژنوم های به دست آمده مربوط به اعماق مختلف دریای کاسپین نشان دهنده تفاوتهای بارز در سطوح پایین تر تاکسونومیکی در سه عمق مختلف بود که می تواند تحت تاثیر نور و یا دما باشد.
توصیف دقیق تر ژنوم های مربوط به شاخه های "Actinobacteria " و "Thaumarchaeota " و رده "Alphaproteobacteria " به عنوان گروههای تاکسونومیکی که اعضای آن از نظر فیلوژنتیکی به تغییر درصد شوری در محیط پاسخ می دهند نشان داد که بیشتر ژنوم های جدا شده از دریای کاسپین متعلق به گروههای معرفی نشده میکروبی و بسته به مورد دارای ارتباط نزدیکتر به یکی از گروههای آب شیرین و یا آب اقیانوسی هستند. الگوی فیلوژنتیک ژنومهای دریای کاسپین نشان دهنده مبداهای فیلوژنتیکی چندگانه و مجزای ژنوم های کاسپین بود که مرتبط با گروههای مشابه متعلق به آب شیرین و اقیانوسی است.